・1000系　8連6編成　6連15編成　4連12編成　2連9編成(栂野車両基地所属)

主に新田原電鉄や下中電鉄に直通する快速列車に使用される形式。4両編成の一部はワンマン対応改造が行われ、本線(栂野～印南)と矢谷岬線でワンマン運行を行っている。

・1500系　6連8編成　4連16編成　2連12編成(栂野車両基地所属)

1000系の増備車となる形式。1000系とは共通運用である。こちらも4両編成の一部はワンマン対応改造が行われている。

・2000系　8連12編成　6連17編成　4連7編成　2連12編成(栂野車両基地所属)

主に快速列車に使用される形式。1000・1500系とは異なり他社への乗り入れには対応していない。2018年より一部車両が更新工事を受け、下中電鉄への乗り入れを開始する予定。

・3000系　5連7編成　3連9編成　2連11編成(伊那車両基地所属)

主に空港快速に使用される形式。大荷物に対応するため、車内は1-2列のクロスシートとし、通路幅を広くしている。この通路幅を活用し、朝夕ラッシュ時には本線快速でも使用されている。

・5000系　6連17編成　4連16編成　2連17編成(栂野車両基地所属)

主に普通列車に使用される形式。車内はロングシートである。下中電鉄への直通にも対応しており、昼間の普通列車は大半がこの形式である。3000系と同様、ラッシュ時には本線快速にも使用される。

・800系　6連6編成　4連5編成(栂野車両基地所属)

本線に運用される車両では最古参。現在はラッシュ時のみ使用されている。この形式は矢谷副都心線には乗り入れない。